这个案件的关键在于责任认定。根据《劳动和社会保障部关于确立劳动关系有关事项的通知》第四条规定 ，建筑施工、矿山企业等用人单位将工程或经营权发包给不具备用工主体资格的组织或自然人，对该组织或自然人招用的劳动者，由具备用工主体资格的发包方承担用工主体责任。在这个案子里，某建设工程有限公司把项目发包给了不具备用工主体资格的李某 ，黄某又是李某雇佣来从事劳动的，所以按照这条规定，某建设工程有限公司就应该承担用工主体责任。另外，《中华人民共和国劳动合同法》第九十四条也明确提到，个人承包经营违反本法规定招用劳动者，给劳动者造成损害的，发包的组织与个人承包经营者承担连带赔偿责任。这就是为什么一审法院会做出那样的判决，某建设工程有限公司要支付工资，李某承担连带责任。

你说的没错，由于包工头不具备用工主体资格，没办法像正规用人单位那样，和农民工签订完善的劳动合同，也难以保障农民工的各项权益。一旦出现拖欠工资、工伤等问题，因为没有规范的劳动关系证明和保障机制，农民工就很难维护自己的权益。就像刚才这个案例中的黄某，虽然有工资表证明被拖欠工资，但追讨起来还是困难重重。而且，很多农民工法律意识淡薄，不知道自己有哪些权益，也不清楚如何通过法律途径维权，这也让他们在权益受损时更加被动。

如果是遇到工伤问题，依据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释 (二)》第一条，农民工可以请求具备合法经营资格的承包人承担认定工伤后的工伤保险待遇责任。当然，首先要及时申请工伤认定 ，一般是在事故伤害发生之日起30日内，由所在单位向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请；如果单位不申请，农民工及其近亲属也可以在一年内自行申请。总之，农民工要增强法律意识，了解自己的权益，在权益受损时及时采取正确的法律途径维权。